Busca, Indexação e definição de base de dados integrada de Escherichia Coli
Este trabalho adota dados provenientes da base de dados da KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes), devido a sua divisão hierárquica em vias metabólicas e descrições interespécies para calcular a similaridade semântica entre quaisquer genes G1 e G2 de organismos modelos, como a Escherichia Co...
| Publicado no: | XXIV Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica da UTFPR |
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| Principais autores: | Violante, Douglas Ribeiro, Lopes, Fabrício Martins |
| Formato: | Trabalho Apresentado em Evento |
| Idioma: | Português |
| Publicado em: |
2020
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| Assuntos: | |
| Acesso em linha: |
http://eventos.utfpr.edu.br//sicite/sicite2019/paper/view/4096/1303 http://eventos.utfpr.edu.br//sicite/sicite2019/paper/view/4096 |
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| Resumo: |
Este trabalho adota dados provenientes da base de dados da KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes), devido a sua divisão hierárquica em vias metabólicas e descrições interespécies para calcular a similaridade semântica entre quaisquer genes G1 e G2 de organismos modelos, como a Escherichia Coli, Drosophila Melanogaster, Saccharomyces Cerevisiae e Arabdopsis Thaliana. Foi desenvolvido um script que pode ser descrito em duas partes, a primeira parte trata da geração do grafo acíclico direcionado, e a segunda parte trata do cálculo da similaridade baseada em similaridade semântica. Os scripts permitem que futuramente poderá ser levada em conta informações como os termos GO (Gene Ontology) e KO (KEGG Orthology), atualmente introduzidos e considerados, podendo assim elevar a precisão do cálculo. |
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