Registro fonte: Dinâmica e homeostase do retroelemento Tnt1 e sua participação nas vias do etileno em plantas de Nicotiana tabacum

Dinâmica e homeostase do retroelemento Tnt1 e sua participação nas vias do etileno em plantas de Nicotiana tabacum

It is known that expression of the Tnt1 retroelement is stress-induced, suggesting that it may play a role in plant development. To verify the dynamics and expression of Tnt1 in plants growing under homeostatic condition, we performed expression analyzes of the circadian clock genes (NtTOC1 and NtCP...

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Autor principal:	Dias, Henrique Moura
Formato:	Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação)
Idioma:	Português
Publicado em:	Universidade Tecnológica Federal do Paraná 2020
Assuntos:	Genética molecular Plantas - Efeito do etileno Fumo Molecular genetics Plants - Effect of ethylene on Tobacco CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::RECURSOS FLORESTAIS E ENGENHARIA FLORESTAL
Acesso em linha:	http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/10919
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id	riut-1-10919
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spelling	riut-1-109192020-11-13T12:24:14Z Dinâmica e homeostase do retroelemento Tnt1 e sua participação nas vias do etileno em plantas de Nicotiana tabacum Dynamics and homeositase of the Tnt1 retroelement and its participation in the ethylene pathways in plants of Nicotiana tabacum Dias, Henrique Moura Perseguini, Juliana Morini Küpper Cardoso Filho, José Hernandes Lopes Perseguini, Juliana Morini Küpper Cardoso Kuhn, Betty Cristiane Ghisi, Nédia de Castilhos Genética molecular Plantas - Efeito do etileno Fumo Molecular genetics Plants - Effect of ethylene on Tobacco CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::RECURSOS FLORESTAIS E ENGENHARIA FLORESTAL It is known that expression of the Tnt1 retroelement is stress-induced, suggesting that it may play a role in plant development. To verify the dynamics and expression of Tnt1 in plants growing under homeostatic condition, we performed expression analyzes of the circadian clock genes (NtTOC1 and NtCP23), ethylene biosynthesis (ACO1 and ACO2), ethylene responsive genes (ER24, JERF1 and TEIL) and different Tnt1 regions (U3A, U3B, U3C and RT) by quantitative PCR technique (qPCR). The cDNA was produced with total RNA extracted from tobacco seedlings with 15 days of in vitro germination (9 collection points in 48 hours). qPCR were performed using Master Mix SYBR Green. The expression data were normalized through the reference gene L25, following data analysis methodology 2-ΔCt (threshold cycle). As expected, genes related to the circadian clock and ethylene biosynthesis follow a rhythmic expression. Ethylene responsive genes present a less evident rythmicity (related to the circadian cycle). Tnt1 presented great variation among the biological replicates. Although it seems to follow a cyclical expression, it seems to be displaced between days. These results suggest that although there is a basal expression of the Tnt1 subfamilies, it does not follow the circadian rhythm. Induction of Tnt1 expression by ethylene may require exposure to higher levels of the phytohormone, and in homeostasis its basal expression may be influenced by other factors that we do not yet understand. Conselho Nacional do Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) A demonstração de que a ativação do retroelemento Tnt1 é induzida pelo estresse tem dado suporte à hipótese de que, em condições adversas, a expressão pode estar atrelada a um mecanismo importante de regulação gênica em vias relacionadas ao desenvolvimento vegetal, tal como a via do Etileno. Com intuito de verificar inicialmente a dinâmica e expressão de Tnt1 em condição de homeostase, foram realizadas análises de expressão dos genes do relógio circadiano de Nicotiana tabacum (NtTOC1 e NtCP23), da biossíntese do Etileno (ACO1 e ACO2), genes de resposta a Etileno (ER24, JERF1 e TEIL) e regiões de Tnt1 (U3A, U3B, U3C e RT) através da técnica de PCR quantitativa (qPCR). Para tal, cDNA foi produzido a partir de RNA total extraído de plântulas de N. tabacum 15 dias após germinação in vitro (em 9 pontos de coletas ao longo de 48 horas). As reações de qPCR foram realizadas utilizando o Master Mix SYBR Green (Thermo Fisher Scientific). Os dados de expressão foram normalizados através do gene de referência L25, seguindo metodologia de análise de dados 2−ΔCt (ciclo limiar). Genes relacionados ao relógio circadiano e síntese de etileno seguem uma variação de expressão rítmica. Genes responsivos ao etileno apresentam uma variação menos evidente, embora também relacionada à fase do ciclo circadiano. Tnt1 apresentou grande variação entre as réplicasbiológicas. Embora, pareça seguir uma expressão cíclica, esta parece estar deslocada entre o primeiro e o segundo dia. Estes resultados sugerem que embora haja uma expressão basal das diferentes subfamílias de Tnt1, ela não segue o ritmo circadiano. Assim, a indução da expressão de Tnt1A por etileno deve requerer uma exposição ao fitormômio maior que um determinado limiar, sendo que em condições de homeostase sua expressão basal pode ser influenciada por outros fatores que ainda não compreendemos. 2020-11-13T12:24:14Z 2020-11-13T12:24:14Z 2018-12-05 bachelorThesis DIAS, Henrique Moura. Dinâmica e homeostase do retroelemento Tnt1 e sua participação nas vias do etileno em plantas de Nicotiana tabacum. 2018. 28 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Dois Vizinhos, 2018. http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/10919 por embargoedAccess application/pdf Universidade Tecnológica Federal do Paraná Dois Vizinhos Brasil Engenharia Florestal UTFPR
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description	It is known that expression of the Tnt1 retroelement is stress-induced, suggesting that it may play a role in plant development. To verify the dynamics and expression of Tnt1 in plants growing under homeostatic condition, we performed expression analyzes of the circadian clock genes (NtTOC1 and NtCP23), ethylene biosynthesis (ACO1 and ACO2), ethylene responsive genes (ER24, JERF1 and TEIL) and different Tnt1 regions (U3A, U3B, U3C and RT) by quantitative PCR technique (qPCR). The cDNA was produced with total RNA extracted from tobacco seedlings with 15 days of in vitro germination (9 collection points in 48 hours). qPCR were performed using Master Mix SYBR Green. The expression data were normalized through the reference gene L25, following data analysis methodology 2-ΔCt (threshold cycle). As expected, genes related to the circadian clock and ethylene biosynthesis follow a rhythmic expression. Ethylene responsive genes present a less evident rythmicity (related to the circadian cycle). Tnt1 presented great variation among the biological replicates. Although it seems to follow a cyclical expression, it seems to be displaced between days. These results suggest that although there is a basal expression of the Tnt1 subfamilies, it does not follow the circadian rhythm. Induction of Tnt1 expression by ethylene may require exposure to higher levels of the phytohormone, and in homeostasis its basal expression may be influenced by other factors that we do not yet understand.
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Dinâmica e homeostase do retroelemento Tnt1 e sua participação nas vias do etileno em plantas de Nicotiana tabacum

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