Registro fonte: Mapeamento de QTLs associados à resistência do trigo à giberela e a níveis de produção de deoxynivalenol, por desequilíbrio de ligação

Mapeamento de QTLs associados à resistência do trigo à giberela e a níveis de produção de deoxynivalenol, por desequilíbrio de ligação

Fusarium head blight is one of the main diseases that affects the wheat crop, causing losses of productivity, besides making possible the production of deoxynivalenol mycotoxin, highly harmful to the individuals that ingest it. The marker assisted selection can help these programs to reduce time and...

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Autor principal:	Moura, Monique Maculan
Formato:	Tese
Idioma:	Português
Publicado em:	Universidade Tecnológica Federal do Paraná 2018
Assuntos:	Pragas agrícolas - Controle Leveduras (Fungos) Micotoxinas Melhoramento de cultivos agrícolas Agricultural pests - Control Yeast fungi Mycotoxins Crop improvement CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA Fitotecnia
Acesso em linha:	http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/3060
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spelling	riut-1-30602018-04-03T16:09:33Z Mapeamento de QTLs associados à resistência do trigo à giberela e a níveis de produção de deoxynivalenol, por desequilíbrio de ligação Mapping of QTLs associated to wheat resistance to Fusarium head blight and levels of deoxynivalenol production, by linkage-disequilibrium Moura, Monique Maculan Benin, Giovani http://lattes.cnpq.br/8634180310157308 Schuster, Ivan http://lattes.cnpq.br/9991337319211428 Benin, Giovani Finatto, Taciane Silva, Glacy Jaqueline da Marchioro, Volmir Sergio Pragas agrícolas - Controle Leveduras (Fungos) Micotoxinas Melhoramento de cultivos agrícolas Agricultural pests - Control Yeast fungi Mycotoxins Crop improvement CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA Fitotecnia Fusarium head blight is one of the main diseases that affects the wheat crop, causing losses of productivity, besides making possible the production of deoxynivalenol mycotoxin, highly harmful to the individuals that ingest it. The marker assisted selection can help these programs to reduce time and costs in development of new cultivars resistant to Fusarium head blight, but for a better efficience, is required knowing the location of genes or QTLs associated to the trait. The objective of this research was to identify SNPs associated to genes/QTLs of resistance to Fusarium head blight and deoxynivalenol production in a wheat cultivars group, for use in MAS on wheat genetic breeding. Were used 384 cultivars to evaluate the Fusarium head blight resistance. Genotyping was using the chip with 35,000 SNPs markers. The population structure was estimate by the algorithm Marcov Chain Monte Carlo for the generalised Bayesian clustering method. The association analysis was performing using the Mixed Linear models method, with 0.001% of significance level, and, stepwise multiple regression, besides an analysis of Pearson‟s correlation. The results showed that the resistance of brazilian wheat genotypes to Fusarium head blight is not related to the QTLs on chromosome 3B, often associated to the Fhb1 gene, but to the QTLs present on chromosomes 1B, 4D and 7D whose explained 13.6% of phenotypic variation. The DON mycotoxin analysis identified nine significant SNPs associated to QTLs on chromosomes 1A, 1B, 1D, 2D, 3D, 5D, 6D and 7B with 65.7% of phenotypic explanation to deoxynivalenol production. In addition, both correlation and association analysis suggest distinct genetic control acting to determine the characteristics. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Paraná A giberela é uma das principais doenças que acometem a cultura do trigo, causando perdas de produtividade, além de possibilitar a produção da micotoxina deoxynivalenol, altamente prejudicial aos indivíduos que a ingerem. A seleção assistida por marcadores pode auxiliar estes programas a reduzir o tempo e os custos no desenvolvimento de novas cultivares resistentes à giberela, mas para ser eficiente é necessário conhecer a localização dos genes/QTLs associados à característica. O objetivo desta pesquisa foi identificar marcadores SNPs associados a genes/QTLs de resistência à giberela e produção de deoxynivalenol em um grupo de cultivares de trigo, para uso em SAM no melhoramento genético de trigo. Foram utlizadas 384 cultivares para avaliação da resistência à giberela. A genotipagem foi efetuada utilizando o chip com 35.000 marcadores SNPs. A estrutura populacional foi estimada pelo algoritmo Marcov Chain Monte Carlo para o método de agrupamento Bayesiano generalizado. A análise de associação foi realizada utilizando o método de Modelos Lineares Mistos, com nível de significância de 0,001%, e, regressão múltipla stepwise, além de uma análise de correlação de Pearson. Os resultados demonstraram que a resistência de genótipos brasileiros de trigo à giberela não está relacionada à QTLs presentes nos cromossomos 3B, frequentemente associada ao gene Fhb1, mas à QTLs presentes nos cromossomos 1B, 4D e 7D que explicaram 13,6% da variação fenotípica. As análises de micotoxina deoxynivalenol identificaram SNPs associados a QTLs nos cromossomos 1A, 1B, 1D, 2D, 3D, 5D, 6D e 7B, com 65,7% de explicação fenotípica para produção de deoxynivalenol. Além disso, tanto as análises de correlação, quanto de associação sugerem controle genético distinto atuando na determinação das características. Palavras-chave: Gibberella 2018-04-03T16:09:32Z 2018-04-03T16:09:32Z 2018-02-23 doctoralThesis MOURA, Monique Maculan. Mapeamento de QTLs associados à resistência do trigo à giberela e a níveis de produção de deoxynivalenol, por desequilíbrio de ligação. 2018. 109 f. Tese (Doutorado em Agronomia) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Pato Branco, 2018. http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/3060 por openAccess application/pdf Universidade Tecnológica Federal do Paraná Pato Branco Brasil Programa de Pós-Graduação em Agronomia UTFPR
institution	Universidade Tecnológica Federal do Paraná
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description	Fusarium head blight is one of the main diseases that affects the wheat crop, causing losses of productivity, besides making possible the production of deoxynivalenol mycotoxin, highly harmful to the individuals that ingest it. The marker assisted selection can help these programs to reduce time and costs in development of new cultivars resistant to Fusarium head blight, but for a better efficience, is required knowing the location of genes or QTLs associated to the trait. The objective of this research was to identify SNPs associated to genes/QTLs of resistance to Fusarium head blight and deoxynivalenol production in a wheat cultivars group, for use in MAS on wheat genetic breeding. Were used 384 cultivars to evaluate the Fusarium head blight resistance. Genotyping was using the chip with 35,000 SNPs markers. The population structure was estimate by the algorithm Marcov Chain Monte Carlo for the generalised Bayesian clustering method. The association analysis was performing using the Mixed Linear models method, with 0.001% of significance level, and, stepwise multiple regression, besides an analysis of Pearson‟s correlation. The results showed that the resistance of brazilian wheat genotypes to Fusarium head blight is not related to the QTLs on chromosome 3B, often associated to the Fhb1 gene, but to the QTLs present on chromosomes 1B, 4D and 7D whose explained 13.6% of phenotypic variation. The DON mycotoxin analysis identified nine significant SNPs associated to QTLs on chromosomes 1A, 1B, 1D, 2D, 3D, 5D, 6D and 7B with 65.7% of phenotypic explanation to deoxynivalenol production. In addition, both correlation and association analysis suggest distinct genetic control acting to determine the characteristics.
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