Registro fonte: Análise da variabilidade genética de Butia paraguayensis (Barb.Rodr.) Bailey (Arecaceae) no cerrado do planalto de Campo Mourão

Análise da variabilidade genética de Butia paraguayensis (Barb.Rodr.) Bailey (Arecaceae) no cerrado do planalto de Campo Mourão

The following study aimed to analyze the genetic variability from ISSR molecular markers in individuals of Butia paraguayensis (Arecaceae) of great historical and cultural importance, due to the lack of genetic data of the species for the county, its classification as endangered and the presence onl...

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Autor principal:	Nakao, Caroline Naomi
Formato:	Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação)
Idioma:	Português
Publicado em:	Universidade Tecnológica Federal do Paraná 2023
Assuntos:	Indicadores biológicos Butiazeiro Paisagens fragmentadas Indicators (Biology) Syagrus Fragmented landscapes CNPQ::ENGENHARIAS
Acesso em linha:	http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/30978
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id	riut-1-30978
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spelling	riut-1-309782023-03-30T06:07:57Z Análise da variabilidade genética de Butia paraguayensis (Barb.Rodr.) Bailey (Arecaceae) no cerrado do planalto de Campo Mourão Analysis of genetic variability of Butia paraguayensis (Barb.Rodr.) Bailey (Arecaceae) in the Cerrado of Campo Mourão plateau Nakao, Caroline Naomi Bueno, Paulo Agenor Alves Bueno, Paulo Agenor Alves Caxambú, Marcelo Galeazzi Bueno, Raquel de Oliveira Indicadores biológicos Butiazeiro Paisagens fragmentadas Indicators (Biology) Syagrus Fragmented landscapes CNPQ::ENGENHARIAS The following study aimed to analyze the genetic variability from ISSR molecular markers in individuals of Butia paraguayensis (Arecaceae) of great historical and cultural importance, due to the lack of genetic data of the species for the county, its classification as endangered and the presence only in the Cerrado remnants for the state of Paraná. Leaf samples were collected from twenty-four accessions in two distinct areas, the Cerrado remnant and the Federal Technological University of Paraná. The samples sent to the Laboratory of Molecular Biology underwent extraction and purification processes, polymerase chain reaction and electrophoresis, being statistically analyzed for the polymorphic content of the primers, and diversity indexes such as genetic similarity by Jaccard index, number of observed and effective alleles, genetic diversity of Nei and Shannon and its genetic and geographical distance correlation in Mantel test. Five primers obtained a good amplification pattern with PIC ranging between 0.14 and 0.21 and temperatures ranging between 46 ºC and 54.8 ºC. The average observed allele count was 1.55 and the effective allele count was 1.25. The Nei diversity index was equal to 0.15 and the Shannon index equal to 0.23 indicating a low level of diversity as well as in the polymorphism rate (52%). Jaccard's similarity for the twenty-four samples ranged from 0.0714 to 0.9167. Mantel's test revealed r = 0.03 resulting in geographic distance as not very significant relative to genetic distance. The low genetic variability denotes the importance of further studies for adequate management of the remaining individuals of B. paraguayensis from Campo Mourão. O seguinte estudo teve como objetivo analisar a variabilidade genética a partir de marcadores moleculares ISSR em indivíduos de Butia paraguayensis (Arecaceae) de grande importância histórico-cultural, devido a carência de dados genéticos da espécie para o município, sua classificação como ameaçada de extinção e a presença somente nos remanescentes de Cerrado para o estado do Paraná. Foram coletadas amostras foliares de vinte e quatro acessos em duas áreas distintas, o remanescente de Cerrado e a Universidade Tecnológica Federal do Paraná. As amostras encaminhadas para o Laboratório de Biologia Molecular passaram pelos processos de extração e purificação, reação em cadeia de polimerase e eletroforese, sendo analisadas estatisticamente quanto ao índice de conteúdo polimórfico dos primers, e índices de diversidade como a similaridade genética pelo índice de Jaccard, número de alelos observados e efetivos, diversidade genética de Nei e Shannon e sua correlação de distância genética e geográfica em teste de Mantel. Cinco primers obtiveram um bom padrão de amplificação com PIC variando entre 0,14 e 0,21 e temperaturas variando entre 46 ºC e 54.8 ºC. A média de alelos observada foi de 1,55 e a efetiva de 1,25. O índice de diversidade de Nei foi igual a 0,15 e o índice de Shannon igual a 0,23 indicando um baixo nível de diversidade assim como na taxa de polimorfismo (52%). A similaridade de Jaccard para as vinte e quatro amostras variou entre 0,0714 e 0,9167. O teste de Mantel revelou r = 0,03 resultando na distância geográfica como pouco significativa em relação a distância genética. A baixa variabilidade genética denota a importância de estudos complementares para manejos adequados dos indivíduos remanescentes de B. paraguayensis de Campo Mourão. 2023-03-29T19:35:51Z 2023-03-29T19:35:51Z 2022-11-30 bachelorThesis NAKAO, Caroline Naomi. Análise da variabilidade genética de Butia paraguayensis (Barb.Rodr.) Bailey (Arecaceae) no cerrado do planalto de Campo Mourão. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Engenharia Ambiental) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Campo Mourão, 2022. http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/30978 por openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ application/pdf Universidade Tecnológica Federal do Paraná Campo Mourao Brasil Departamento Acadêmico de Ambiental Engenharia Ambiental UTFPR
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description	The following study aimed to analyze the genetic variability from ISSR molecular markers in individuals of Butia paraguayensis (Arecaceae) of great historical and cultural importance, due to the lack of genetic data of the species for the county, its classification as endangered and the presence only in the Cerrado remnants for the state of Paraná. Leaf samples were collected from twenty-four accessions in two distinct areas, the Cerrado remnant and the Federal Technological University of Paraná. The samples sent to the Laboratory of Molecular Biology underwent extraction and purification processes, polymerase chain reaction and electrophoresis, being statistically analyzed for the polymorphic content of the primers, and diversity indexes such as genetic similarity by Jaccard index, number of observed and effective alleles, genetic diversity of Nei and Shannon and its genetic and geographical distance correlation in Mantel test. Five primers obtained a good amplification pattern with PIC ranging between 0.14 and 0.21 and temperatures ranging between 46 ºC and 54.8 ºC. The average observed allele count was 1.55 and the effective allele count was 1.25. The Nei diversity index was equal to 0.15 and the Shannon index equal to 0.23 indicating a low level of diversity as well as in the polymorphism rate (52%). Jaccard's similarity for the twenty-four samples ranged from 0.0714 to 0.9167. Mantel's test revealed r = 0.03 resulting in geographic distance as not very significant relative to genetic distance. The low genetic variability denotes the importance of further studies for adequate management of the remaining individuals of B. paraguayensis from Campo Mourão.
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