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Validação de marcadores do tipo SSRs identificados em regiões de QTLs relacionados com a resistência à antracnose no feijoeiro

In order to have increasingly better and bigger production, plants are submitted to selections, crossbreds and DNA's modifications, being these the main vegetal improving resources. About plants' selection, nowadays there are techniques which allow to realize this selection only from their...

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Autor principal: Sartor, Klaiton Luis Cagnini
Formato: Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação)
Idioma: Português
Publicado em: Agronomia 2022
Assuntos:
Feijão-comum
Plantas - Melhoramento genético
Colletotrichum lindemuthianum
Common bean
Plant breeding
CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA
Acesso em linha: http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/30046
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spelling riut-1-300462022-11-09T06:07:31Z Validação de marcadores do tipo SSRs identificados em regiões de QTLs relacionados com a resistência à antracnose no feijoeiro SSRs markers’ validation identified in regions of QTLs related to bean anthracnose resistance Sartor, Klaiton Luis Cagnini Perseguini, Juliana Morini Küpper Cardoso Domingues, Lucas da Silva Perseguini, Juliana Morini Küpper Cardoso Ghisi, Nédia de Castilhos Waclawovsky, Alessandro Jaquiel Feijão-comum Plantas - Melhoramento genético Colletotrichum lindemuthianum Common bean Plant breeding CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA In order to have increasingly better and bigger production, plants are submitted to selections, crossbreds and DNA's modifications, being these the main vegetal improving resources. About plants' selection, nowadays there are techniques which allow to realize this selection only from their DNA, without the necessity of expressing the individual's phonotype. One of these techniques is the marker-assisted selection (MAS). The called microsatellites markers or Simple Sequence Repeat (SSRS) are advocated by many researchers as the ones which are more competent and applicable to several species. One of the applicabilities of such markers is the selection of plants resistant to pathogens, for instance, the resistance of beans (Phaseolus vulgaris L.) to anthracnose (Colletotrichum lindemuthianum). The aim of this resource was to validate SSRS molecular markers previously identified in regions of QTLs (Quantitative Trait Loci) on bean plants to analyze if they are actually related to anthracnose resistance. This survey started by planting 16 beans' genotypes and still on its vegetative stage their leaves were collected in order to extract each genotype. Having the AND in vitro, 9 molecular markers were amplified through PCR (Polymerase Chain Reaction) and after that the bands amplified on agarose gel were compared with two parental bands, CAL-143 and IAC-UNA, being one susceptible and the other resistant to anthracnose, respectively. From the field data, where were evaluated the 16 genotypes' resistance to anthracnose, it was made a comparative with the amplifications in agarose gel. Five valid markers can be pointed: SSR-IAC284, SSR-IAC65, SSR-IAC239, SSR-IAC245 e SSR-IAC268. However, more tests need to be done for the other markers intending to prove if they are or are not really related to anthracnose resistance. This resource result allows these 5 markers to be used in future plants assisted selections, to make the improver work quicker and more efficient. Para que a produção seja cada vez maior e de melhor qualidade, as plantas são submetidas a seleções, cruzamentos e modificações em seu DNA, sendo estas as principais ferramentas do melhoramento vegetal. Com relação a seleção de plantas, atualmente existem técnicas que permitem realizar essa seleção somente a partir de seus DNAs, sem a necessidade de expressão do fenótipo daquele indivíduo. Uma destas técnicas é a seleção assistida por marcadores moleculares (SAM). Os marcadores do tipo microssatélite ou SSRS (Simple Sequence Repeats) são defendidos por muitos pesquisadores como os de melhor competência e aplicabilidade a diversas espécies. Uma das aplicabilidades destes marcadores é a seleção de plantas resistente a patógenos, como por exemplo, a resistência do feijão (Phaseolus vulgaris L.) à antracnose (Colletotrichum lindemuthianum). O objetivo deste trabalho foi validar marcadores moleculares do tipo SSRS previamente identificados em regiões de QTLs (Quantitative Trait Loci) no feijoeiro para saber se os mesmos estão de fato relacionados com a resistência à antracnose. Este trabalho iniciou com a semeadura de 16 genótipos de feijão e ainda em seu estádio vegetativo foram coletadas as folhas para que o DNA de cada genótipo fosse extraído. Com o DNA in vitro, foi feita a amplificação de 9 marcadores moleculares através de PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) e posteriormente foi realizada a comparação das bandas amplificadas em gel de agarose com bandas de dois parentais, CAL-143 e IAC-UNA, sendo um suscetível e outro resistente à antracnose, respectivamente. A partir de dados de campo, onde foi avaliada a resistência à antracnose dos 16 genótipos, foi efetuado um comparativo com as amplificações em gel de agarose. Cinco marcadores podem ser apontados como sendo válidos: SSR-IAC284, SSRIAC65, SSR-IAC239, SSR-IAC245 e SSR-IAC268. Porém, para os demais marcadores mais testes devem ser realizados para realmente comprovar se estão ou não relacionados a resistência à antracnose. O resultado deste trabalho permite que esses 5 marcadores sejam utilizados em futuras seleções assistidas de plantas para tornar o trabalho do melhorista mais rápido e eficiente. 2022-11-08T14:30:26Z 2022-11-08T14:30:26Z 2019-06-27 bachelorThesis SARTOR, Klaiton Luis Cagnini. Validação de marcadores do tipo SSRs identificados em regiões de QTLs relacionados com a resistência à antracnose no feijoeiro. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Agronomia) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Dois Vizinhos, 2019. http://repositorio.utfpr.edu.br/jspui/handle/1/30046 por openAccess application/pdf Agronomia Dois Vizinhos Brasil Universidade Tecnológica Federal do Paraná UTFPR
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description In order to have increasingly better and bigger production, plants are submitted to selections, crossbreds and DNA's modifications, being these the main vegetal improving resources. About plants' selection, nowadays there are techniques which allow to realize this selection only from their DNA, without the necessity of expressing the individual's phonotype. One of these techniques is the marker-assisted selection (MAS). The called microsatellites markers or Simple Sequence Repeat (SSRS) are advocated by many researchers as the ones which are more competent and applicable to several species. One of the applicabilities of such markers is the selection of plants resistant to pathogens, for instance, the resistance of beans (Phaseolus vulgaris L.) to anthracnose (Colletotrichum lindemuthianum). The aim of this resource was to validate SSRS molecular markers previously identified in regions of QTLs (Quantitative Trait Loci) on bean plants to analyze if they are actually related to anthracnose resistance. This survey started by planting 16 beans' genotypes and still on its vegetative stage their leaves were collected in order to extract each genotype. Having the AND in vitro, 9 molecular markers were amplified through PCR (Polymerase Chain Reaction) and after that the bands amplified on agarose gel were compared with two parental bands, CAL-143 and IAC-UNA, being one susceptible and the other resistant to anthracnose, respectively. From the field data, where were evaluated the 16 genotypes' resistance to anthracnose, it was made a comparative with the amplifications in agarose gel. Five valid markers can be pointed: SSR-IAC284, SSR-IAC65, SSR-IAC239, SSR-IAC245 e SSR-IAC268. However, more tests need to be done for the other markers intending to prove if they are or are not really related to anthracnose resistance. This resource result allows these 5 markers to be used in future plants assisted selections, to make the improver work quicker and more efficient.
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